Mateusz Gaczyński jest zastępcą dyrektora w Departamencie Innowacji i Rozwoju Ministerstwa Edukacji i Nauki. Na obecnym stanowisku zajmuje się polityką badań i innowacji, w tym instrumentami polityki spójności i programami europejskimi w tym obszarze. Przed objęciem tego stanowiska pracował w Ministerstwie Gospodarki (tematyka polityki spójności, zrównoważonego rozwoju, zmian klimatu, Strategii Lizbońskiej), Stałym Przedstawicielstwie RP przy UE (portfolio polityki spójności i zatrudnienia), Polskiej Agencji Rozwoju Przedsiębiorczości (przedsiębiorczość) oraz Ministerstwie Pracy i Polityki Społecznej (migracja zarobkowa). Jest absolwentem Uniwersytetu Jagiellońskiego i Krajowej Szkoły Administracji Publicznej.